Σε ορισμένες ασθένειες, μπορούμε να υποθέσουμε ότι οφείλεται σε έλλειψη Ωμέγα-3 και να μετριάσουμε την πορεία της νόσου καταναλώνοντας Ωμέγα-3 λιπαρά οξέα. Γενικά, η δυτική διατροφή συνδέεται κυρίως με έλλειψη Ωμέγα-3. Δεν παρατηρούμε στην πραγματικότητα τα άμεσα σημάδια επειδή συχνά αποτελούν ήδη μέρος της καθημερινής ζωής και οι άνθρωποι έχουν μάθει να ζουν με αυτά (διαταραχές ύπνου, έλλειψη συγκέντρωσης, πεπτικά προβλήματα κ.λπ.). Επιπλέον, πολλές αυτοάνοσες ασθένειες μπορεί να είναι αποτέλεσμα έλλειψης Ωμέγα-3 λιπαρών οξέων, ακόμη και αν δεν είχαν παρατηρηθεί προηγουμένως αλλαγές στο σώμα.